Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zeb2Q9R0G7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms