Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bcl11aQ9QYE3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bcl11aQ9QYE3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bcl11aQ9QYE3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms