Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clic4Q9QYB1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clic4Q9QYB1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms