Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VapbQ9QY76 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapbQ9QY76 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms