Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ChmQ9QXG2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms