Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms