Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crlf1Q9JM58 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crlf1Q9JM58 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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