Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cul3Q9JLV5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms