Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms