Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx6Q9JKK1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx6Q9JKK1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms