Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl39Q9JKF7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms