Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap4m1Q9JKC7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms