Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Tuba8Q9JJZ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tuba8Q9JJZ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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