Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpf2Q9JJ80 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rpf2Q9JJ80 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms