Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1fQ9JIS7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms