Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pus3Q9JI38 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms