Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms