Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem27Q9ESG4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Tmem27Q9ESG4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem27Q9ESG4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem27Q9ESG4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem27Q9ESG4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms