Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slco1c1Q9ERB5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slco1c1Q9ERB5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms