Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms