Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms