Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt112Q9DCG9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trmt112Q9DCG9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt112Q9DCG9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms