Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms