Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SelenooQ9DBC0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SelenooQ9DBC0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms