Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap1s2Q9DB50 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms