Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1mQ9DAD9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1mQ9DAD9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms