Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9S1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D9S1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9S1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q9D9S1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms