Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actrt1Q9D9J3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Actrt1Q9D9J3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms