Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot8Q9D8X5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot8Q9D8X5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms