Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms