Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AY761184Q9D848 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AY761184Q9D848 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms