Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp5Q9D7S9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp5Q9D7S9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms