Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttc9bQ9D6E4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms