Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spsb1Q9D5L7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb1Q9D5L7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb1Q9D5L7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms