Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd1Q9D4J1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd1Q9D4J1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms