Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gcc1Q9D4H2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms