Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpc6Q9D4E6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms