Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Batf3Q9D275 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Batf3Q9D275 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms