Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snu13Q9D0T1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snu13Q9D0T1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snu13Q9D0T1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms