Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp3Q9CZX0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp3Q9CZX0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms