Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis18aQ9CZJ6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms