Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nde1Q9CZA6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms