Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mgme1Q9CXC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms