Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MINDY3Q9CV28 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MINDY3Q9CV28 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms