Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifitm3Q9CQW9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifitm3Q9CQW9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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