Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sec61bQ9CQS8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sec61bQ9CQS8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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