Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQM1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQM1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQM1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQM1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CQM1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms