Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer1Q9CQL2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms