Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Use1Q9CQ56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Use1Q9CQ56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Use1Q9CQ56 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Use1Q9CQ56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Use1Q9CQ56 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Use1Q9CQ56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Use1Q9CQ56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Use1Q9CQ56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Use1Q9CQ56 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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