Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Commd4Q9CQ02 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Commd4Q9CQ02 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Commd4Q9CQ02 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Commd4Q9CQ02 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms